¿Qué es ASReml-R?
ASReml-R, el potente paquete estadístico que se ajusta a los modelos lineales mixtos (LMMs) utilizando la máxima verosimilitud residual (REML) en el entorno R.
Esta versión ofrece un marco más unificado y una funcionalidad ampliada para el análisis de LMM, especialmente para conjuntos de datos grandes y complejos. Tiene las siguientes características:
- licencias nuevas y mejoradas
- una sintaxis simplificada y más significativa para la especificación del modelo:
- rcov se convierte en residual y las estructuras de suma directa para los modelos residuales con datos particionados en secciones a las que se aplican estructuras de varianza separadas ahora se especifican lógicamente mediante una función dsum ()
- Las opciones que se utilizan con poca frecuencia se enumeran ahora externamente para la llamada al modelo en una nueva función (Asreml.Options)
- una estructura más unificada para los argumentos relacionados en la llamada a asreml () y el objeto de salida, por ejemplo
- na.action () para tratar los valores que faltan en las variables de respuesta y explicativas
- o un componente de fórmula del objeto ASReml-R que enumera las fórmulas del modelo fijo, aleatorio, disperso y residual
- actualizaciones mejoradas de los modelos analíticos de factores y una variante rr () de clasificación reducida de la función del modelo de varianza fa ()
- una especificación más simple y consistente de los modelos de varianza conocidos (incluidas las matrices de relación) a través de la máquina virtual (función), que también cumple con las matrices singulares conocidas
- ajuste computacionalmente eficiente de los modelos de regresión aleatoria cuando hay más variables que observaciones - motivado por el uso de datos de marcadores SNP para explicar los genotipos
- Más advertencias informativas y mensajes de error
- gráficos mejorados con ggplot2.
Las nuevas características más avanzadas incluyen:
- Introducción del propio modelo de varianza () para permitir la especificación de una estructura de varianza definida por el usuario
- extensiones para modelos lineales generalizados, incluidos modelos de umbral y modelos bivariados con una variable que tiene una distribución normal y la otra variable distribuida a partir de una distribución de familia exponencial
- generar matrices de diseño para permitir el uso de términos y funciones de modelos derivados; Argumento de diseño para Asreml.Options ()
- funciones para generar factores que combinan niveles de un factor o utilizan un subconjunto de niveles para permitir una predicción más fácil de los modelos; combine, prune, gpf (), sbs ().
También se incluyen:
- calcular las funciones de los componentes de la varianza y sus errores estándar aproximados; vpredict ()
- cálculo de criterios de información, incluyendo CBI y BIC.
Requisitos del sistema:
CPU: procesador de doble núcleo a 1,8 GHz
RAM: 2 GB
HDD / SSD: 50 GB de espacio libre en la unidad principal
Sistema operativo: Microsoft Windows 8 de 32 bits, Microsoft Windows 7 de 32 bits y Microsoft Windows Vista de 32 bits
Resolución: 1024×768
Sistemas operativos compatibles
Mac OS X 10.5 x (Leopard), Mac OS X 10.6 (Snow Leopard), Mac OS X 10.7 (Lion), Mac OS X 10.7 (Mountain Lion), OS X 10.9 (Mavericks) y Mac OS X 10.10 (Yosemite)
Requisitos de hardware
Memoria - 1 GB de RAM y más
Espacio libre en disco: 50 MB
Tipo de sistema: sistema operativo de 32 bits y 64 bits