ASReml-R

ASReml-R

ASReml-R, o poderoso pacote estatístico que se ajusta a modelos lineares mistos (LMMs) usando a máxima verossimilhança residual (REML) no ambiente R.

Esta versão oferece uma estrutura mais unificada e funcionalidade estendida para análise LMM, particularmente para conjuntos de dados grandes e complexos. Possue os seguintes recursos:

• licenciamento novo e aprimorado
• uma sintaxe simplificada e mais significativa para a especificação do modelo:

o    rcov torna-se residual e estruturas de soma direta para modelos residuais com dados particionados em seções às quais estruturas de variância separadas são aplicadas agora são especificadas logicamente usando uma   função dsum ()

o    opções raramente usadas agora são listadas externamente para a chamada de modelo em uma nova função asreml.options () 

• uma estrutura mais unificada para argumentos relacionados na chamada para asreml () e o objeto de saída, por exemplo

o    na.action ()  para lidar com valores ausentes nas variáveis de resposta e explicativas

o    um   componente de fórmulas do objeto ASReml-R que lista as fórmulas do modelo fixo, aleatório, esparso e residual

• atualizações aprimoradas em modelos analíticos de fator e uma variante rr () de classificação reduzida da   função de modelo de variância fa ()
• uma especificação mais simples e consistente de modelos de variância conhecidos (incluindo matrizes de relacionamento) por meio da   função vm (), que também atende matrizes singulares conhecidas
• ajuste computacionalmente eficiente de modelos de regressão aleatória quando há mais variáveis do que observações - motivado pelo uso de dados de marcadores SNP para explicar genótipos
• avisos mais informativos e mensagens de erro 
• gráficos melhorados com o ggplot2.

Funcionalidades mais avançadas novas incluem:

• introdução do próprio modelo de variância () para permitir a especificação de uma estrutura de variância definida pelo usuário
• extensões para modelos lineares generalizados, incluindo modelos de limiar e modelos bivariados com uma variável tendo uma distribuição normal e a outra variável distribuída a partir de uma distribuição familiar exponencial
• gerar matrizes de design para permitir o uso de termos e funções de modelo derivados; argumento de design para asreml.options ()
• funções para gerar fatores que combinam níveis de um fator ou usam um subconjunto de níveis para permitir uma previsão mais fácil de modelos; combinar, podar, gpf (), sbs ().

Também incluído:

• funções de computação de componentes de variância e seus erros padrão aproximados; vpredict ()
• cálculo dos critérios de informação, incluindo AIC e BIC.

Requisitos do sistema:

CPU: processador dual core de 1,8 GHz

RAM: 2 GB

HDD / SSD: 50 GB de espaço livre na unidade principal

Sistema operacional: Microsoft Windows 8 32 bits, Microsoft Windows 7 32 bits e Microsoft Windows Vista 32-bit

Resolução: 1024×768

Sistemas operacionais suportados

Mac OS X 10.5 x (Leopard), Mac OS X 10.6 (Snow Leopard), Mac OS X 10.7 (Lion), Mac OS X 10.7 (Mountain Lion), OS X 10.9 (Mavericks) e Mac OS X 10.10 (Yosemite)

Requisitos de hardware

Memória - 1 GB de RAM e mais

Espaço livre em disco - 50 MB 

Tipo de sistema - SO de 32 e 64 bits